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客戶文章-DAP-seq在調控金銀花綠原酸生物合成研究中的應用

更新時間:2022-10-21   點擊次數(shù):1840次

綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Lonicera macranthoides,別稱:金銀花)最重要的活性藥物成分,在醫(yī)學領域對天然CGA的需求急劇增長。雖然CGA生物合成的關鍵基因已有報道,但其轉錄調控機制在很大程度上仍然是未知的。因此,研究CGA生物合成的分子調控機制對于利用基因工程技術培育高CGA含量的金銀花新品種具有重要意義。

2021年4月29日,重慶文理學院園林與生命科學學院陳澤雄教授的研究成果,發(fā)表在植物科學領域的學術期刊Plant Science上,文章題目為“A R2R3-MYB transcriptional activator LmMYB15 regulates chlorogenic acid biosynthesis and phenylpropanoid metabolism in Lonicera macranthoides",該期刊的影響因子為5.363。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq) 技術鑒定了金銀花R2R3-MYB轉錄因子LmMYB15的DNA結合基序及其靶基因。進一步研究揭示了LmMYB15調控金銀花CGA生物合成和苯丙素代謝的分子機制,該研究成果為利用基因工程策略開發(fā)富含CGA的金銀花新品種提供了寶貴的基因資源。

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該研究首先通過對金銀花不同發(fā)育時期的不同組織進行質譜檢測和轉錄圖譜分析,發(fā)現(xiàn)LmMYB3、LmMYB4、LmMYB15LmMYB31基因與CGA的含量存在顯著的相關性,表明這些基因在調控CGA生物合成中發(fā)揮潛在作用。LmMYB15和其他MYBs蛋白質的系統(tǒng)發(fā)育樹分析結果表明,LmMYB15與紅花CtMYB1、擬南芥AtMYB15和AtMYB14、番茄SlMYB15和菊花CmMYB15具有相近的同源性。酵母雙雜交試驗表明LmMYB15可作為轉錄激活因子。在煙草中過表達LmMYB15基因,促使CGA的含量顯著增加,表明LmMYB15是CGA生物合成的正調控因子。

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圖1. DAP-seq分析鑒定全基因組范圍的LmMYB15靶基因

(A) LmMYB15結合的peaks在基因組上的分布分析。(B) 通過MEME-Chip分析篩選LmMYB15的DNA結合基序,其中(C/T) (C/T) (C/T) ACCTA(C/A) (C/T) (A/T) (即YYYACCTAMYW) 和 (C/T)ACCTA(C/A)(即YACCTAM)為最集中富集的2個基序。


為了闡明LmMYB15的分子機制,采用DAP-seq技術鑒定了LmMYB15的DNA結合基序及其直接的下游靶基因,包括4CL、MYB3MYB4、KNAT6/7、IAA26ETR2。酵母單雜交和雙熒光素酶報告基因實驗證實,LmMYB15可以結合4CLMYB3MYB4的啟動子,并激活這些基因的表達,從而促進CGA的生物合成和苯丙素代謝。該研究揭示了一種LmMYB15調控金銀花CGA生物合成的新的分子機制,同時為高CGA含量的金銀花育種策略提供了新途徑,這對于提高金銀花的藥用性能具有重要意義。

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圖2. LmMYB15正向調控CGA生物合成的分子機制模式圖

總結:該研究從金銀花中分離到一個R2R3 MYB轉錄因子LmMYB15,它是CGA生物合成的正調控因子,它直接與下游靶基因的啟動子結合,包括4CLMYB3MYB4,從而促進CGA的積累和苯丙素代謝。該研究為CGA生物合成的轉錄調控機制提供了新見解,同時為培育具有更高藥用價值的高CGA含量金銀花新品種提供了新策略。



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